El centro de control está ubicado en el parque de maquinaria del Ministerio de Fomento en la Avenida de Avda Cataluña Nº301, de Zaragoza, en los edificios del Centro de Conservación del Z-5.
 
El centro de control consta de una sala principal, una sala de reuniones separada de la sala principal por una mampara de cristal y un cuarto en el que se disponen los SAIs instalado.
La sala principal  se encuentra equipada con una pantalla VIDEOWALL que permite controlar las 17 cámaras que se han instalado en los túneles.
 
Desde este centro se controlan los equipos del túnel (iluminación, ventilación, señalización, aforos, portes SOS, megafonía, etc).
 
El centro de Control cuenta con presencia de personal las 24h durante todos los días del año.